招标控制价清单与中标价清单不一致，让利该怎样计算？

根据你的描述，应该不是清单报价，出现此情况，让利系数可以根据事情情况来决定。

如清单报价和控制价清单相似，差价不大，可以选择1-中标价/招标控制价。

如果两者相差较大，可以选择相似项之和，进行计算。

一般甲方和审计可以接受的是第一种

这个应该是废标吧，清单是由建设单位或招标单位提供的，投标单位 没有权力修改或增加吧

那你就把那个二十项子目暂时踢出，看看价格差多少，那这个差距就是让利了，你只能这样算，要不然你无法算出这个让利的系数。