合同解释

按补充协议，一般补充协议都有说：未提及的条款与主合同一致，如不一致按本补充协议执行。

难道没有这样的约定？

以补充协议新增的清单单价计价方式为准。

要不然，那主合同里面的计价方式要改，通过什么方式确认呢？对吧

一般在补充协议中会明确本补充协议与主合同不一致的，以补充协议为准。如果没有明确约定，从常理推断，补充协议形成时间在后，以形成时间在后的为双方的最新意思表示，应以补充协议为准。