基础回填，项目特征描述基础土方回填，运距自行考虑。工程师签署运距是否考虑此费用？

要考虑

首先要看合同条款；若合同无特殊要求，签证单有效且属实，应予以增加

要按现场的实际情况确定是否计算的。例如100米内不计算，100米以上的就计算。

土方回填里面的运距是指场内倒土运距吧

因为清单描述中已明确运距自行考虑，也就是你在回填土报价中已经包含了运回填土的费用，工程师即便签署了运距此项费用也无法要到。