未包含在本项目批复范围内的，但又实际已施工的增加项目，结算时能不能计算

可以计算。

那么，道路施工时难道是施工方擅自做主修了新增的路吗？肯定有甲方要求才施工的，找甲方补充说明或协议处理。

明知不在范围，为何不办签证或批准手续，审价删减没错。补办手续吧

如果超概算，建设单位需要报请原概算审批部门报批，手续完成后就合法合理了。